环境工程系成立于2006年，开设环境工程、建筑环境与能源应用工程、给排水科学与工程三个专业，目前有在校生853名。
环境工程教研室主要承担环境工程、给水排水科学与工程和建筑环境与能源应用工程专业教学、化学实验室管理工作和科研工作。在承担教学任务的同时，教研室老师积极探索适合我院人才培养模式的教学改革，其中由本教研室教师主持参与的《基于“双学”的环境工程专业创新教学与实践体系的构建研究》项目被评为华清学院优秀教改项目。发表专业和教改文章多篇其中，核心文章3篇，2篇EI检索。教研室教师积极参加国内、国际学术会议和各种提高教学水平培训，并以网络学习等形式积极提高自身的教学科研水平。
培养目标
本专业培养具备城市和城镇水、气、声、固体废物等污染防治、给排水工程、污染控制规划和水资源保护等方面的知识与较强专业实践技能，有创新思维能力，能在政府部门、规划部门、经济管理部门、环保部门、设计单位、工矿企业、科研单位、学校等从事规划、设计、施工、管理、教育和研究开发方面工作的环境工程学科高级工程技术人才。
规划设计院所、市政工程、科研单位、高等院校、大中型企业以及政府机构相关职能部门，具体从事规划设计、科研教学、检验分析和工程管理等工作；也可以报考环境工程、市政工程、给水排水、环境科学等相关专业研究生。
培养要求
本专业学生主要学习普通化学、工程力学、测量学、工程制图、微生物学、水力学、电工学、环境监测、环境工程学科的基本理论和基本知识，受到外语、计算机技术及绘图、污染物监测和分析、工程设计、管理及规划方面的基本训练，具有环境科学技术和给水排水工程领域的科学研究、工程设计和管理规划方面的基本能力。
课程设置
主干学科：环境科学与工程
主要课程：物理化学、工程流体力学、环境工程微生物学、环境生态学、环境工程原理、环境影响评价、水污染控制、固体废物处理与处置、大气污染控制、环境规划与管理、环境经济学
主要实践性教学环节：测量实习、工程制图、计算机应用及上机实习、水力学实验、微生物实验、环境监测实验、水处理实验、空气污染控制实验等，一般安排40周左右。
就业方向
本专业毕业生就业方向主要为规划设计院所、市政工程、科研单位、高等院校、大中型企业以及政府机构相关职能部门，具体从事规划设计、科研教学、检验分析和工程管理等工作；也可以报考环境工程、市政工程、给水排水、环境科学等相关专业研究生。
就业前景
环境工程专业是一门新兴的学科，建立及发展的历史还不很长。
20世纪以来，根据化学、物理学、生物学、地学、医学等基本理论，运用卫生工程、给排水工程、化学工程、机械工程等技术原理和手段，解决废气、废水、固体废弃物、噪音污染等问题，使单项治理技术有了较大的发展，成为了环境工程学诞生的基础。60年代后期，美国的《国家环境政策法》（NEPA）中，规定了环境影响评价的制度。从此，对环境系统工程和环境污染综合防治的研究工作迅速发展起来。环境工程专业这门新的学科形成了。中国环境工程学科是在70年代中后期才迅速发展起来的，其标志是1977年，清华大学在原有给水排水专业的基础上成立了我国第一个环境工程专业。这也标志着我国的环境工程专业开始了自己的发展历程。截至2000年初，中国大约有140多所大学成立了环境工程专业。
中国政府十分重视环境教育工作，确立了“环境保护，教育为本”的指导思想。环境教育是一项终生教育的基础工程，是提高全民族环境道德素质和环境科学文化素质的基本手段。环境专业教育是中国的环境工作中最重要的一个环节。
环境专业教育的主要对象是环保专业的中等专业学校、职业高中和高等院校的学生。主要任务是有计划地培养环保科技人才和管理人才。中国的环境教育已有20多年的历史，专业设置和结构体系都趋于合理，基本上满足了国家经济建设对环保人才的需求。
环境工程专业仍属于正在发展中的专业，因此还没有吸引更多人的注意。环境工程专业毕业生的需求大部分是在大城市和大企业，以及一些专门做环境方面产品的研制与开发的公司。
由于很多地区或地方上的企业对环境保护还没有足够的重视，因此他们的需求相比之下就小的多，再加上很多地县级的环保部门的人员多数是从原来的卫生防疫部门或其他部门拼凑出来的，也往往缺少对环境工程的重视。这几方面的原因造成我国目前对高校环境工程专业的毕业生的需求不多。但随着环境保护观念宣传的深入，人们对环境意识的加强，有理由相信，未来几年内，对环境工程专业的学生的需求将会大大增加。